Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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FgbQ8K0E8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FgbQ8K0E8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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