Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Pkn3Q8K045 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkn3Q8K045 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkn3Q8K045 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms