Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms