Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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