Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4933409G03RikQ8C5U0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933409G03RikQ8C5U0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms