Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms