Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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