Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atg16l1Q8C0J2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms