Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps114-201ENSMUST00000121050 1040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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