Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms