Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pggt1bQ8BUY9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pggt1bQ8BUY9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Pggt1bQ8BUY9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pggt1bQ8BUY9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pggt1bQ8BUY9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms