Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf144bQ8BKD6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf144bQ8BKD6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf144bQ8BKD6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf144bQ8BKD6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rnf144bQ8BKD6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf144bQ8BKD6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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