Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Atg4dQ8BGV9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Atg4dQ8BGV9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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