Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ubash3bQ8BGG7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Ubash3bQ8BGG7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubash3bQ8BGG7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms