Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim12Q78RX3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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