Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ubfd1Q78JW9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ubfd1Q78JW9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms