Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tmed3Q78IS1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms