Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih3Q6ZWS4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms