Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Snx13Q6PHS6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms