Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chd4Q6PDQ2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms