Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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