Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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