Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Krt40Q6IFX3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Krt40Q6IFX3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Krt40Q6IFX3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Krt40Q6IFX3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Krt40Q6IFX3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Krt40Q6IFX3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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