Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q6DFW0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms