Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms