Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms