Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SrmQ64674 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SrmQ64674 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms