Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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PtprjQ64455 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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PtprjQ64455 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprjQ64455 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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