Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms