Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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