Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim28Q62318 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trim28Q62318 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim28Q62318 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms