Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Sox19Q62249 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sox19Q62249 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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