Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SspnQ62147 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SspnQ62147 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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SspnQ62147 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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