Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itga6Q61739 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Itga6Q61739 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms