Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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