Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PcolceQ61398 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms