Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cln3Q61124 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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