Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samhd1Q60710 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samhd1Q60710 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms