Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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PtprnQ60673 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms