Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms