Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f8Q58FA4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms