Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Esf1Q3V1V3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Esf1Q3V1V3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms