Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms