Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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