Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
D130052B06RikQ3UW13 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D130052B06RikQ3UW13 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D130052B06RikQ3UW13 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
D130052B06RikQ3UW13 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
D130052B06RikQ3UW13 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms