Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm29609Q3UU56 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm29609Q3UU56 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm29609Q3UU56 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm29609Q3UU56 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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