Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms