Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Puf60Q3UEB3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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