Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms