Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ttll12Q3UDE2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ttll12Q3UDE2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms